Neosuite MNPD 微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(Microbial Natural Products Database, NeoSuite)     

創(chuàng)騰科技有限公司和中國醫(yī)學(xué)*醫(yī)藥生物技術(shù)研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD 是基于*的化學(xué)信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 構(gòu)建的，在數(shù)據(jù)庫設(shè)計和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗(yàn)，數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了近幾十年來主要相關(guān)文獻(xiàn)、專著中的微生物代謝物共 15000多個，其中有確切化學(xué)結(jié)構(gòu)式的共 10000多個?；衔锏南嚓P(guān)信息包括來源，制備，理化性質(zhì)，化學(xué)結(jié)構(gòu)，生物活性以及原始文獻(xiàn)等數(shù)據(jù)。MNPD 可以為從事藥物化學(xué)，微生物學(xué)，生物化學(xué)，藥理學(xué)，新藥篩選，天然產(chǎn)物研發(fā)，組合化學(xué)，化學(xué)信息學(xué)等領(lǐng)域的科研人員提供*的幫助，如天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)檢索，虛擬藥物篩選，構(gòu)效關(guān)系研究，作為組合化學(xué)的初始結(jié)構(gòu)等。

1、簡介
Neosuite MNPD 微生物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(Microbial Natural Products Database，MNPD)是創(chuàng)騰科技有限公司和中國醫(yī)學(xué)*醫(yī)藥生物技術(shù)研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。MNPD 是基于*的化學(xué)信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 構(gòu)建的，在數(shù)據(jù)庫設(shè)計和數(shù)據(jù)采集上借鑒了多個已發(fā)布的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)驗(yàn)，數(shù)據(jù)內(nèi)容涵蓋了微生物天然產(chǎn)物的來源、制備、理化性質(zhì)、化學(xué)結(jié)構(gòu)、生物活性以及原始文獻(xiàn)等各方面信息，形成了數(shù)據(jù)全面、可滿足多種功能需求的綜合性的化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫。

2、數(shù)據(jù)庫特性
首先，占 80%*的 MDL ISIS 化學(xué)信息管理系統(tǒng)擁有其*的優(yōu)勢，能夠方便的建立、管理和檢索化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫，并且可以利用通用接口十分方便的與其他系統(tǒng)如 Accelrys 和 Tripos 公司提供的分子模擬及分子設(shè)計軟件配合使用。使用者無需計算機(jī)專業(yè)知識，只需進(jìn)行簡單培訓(xùn)即可對數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索、瀏覽和維護(hù)。另外，據(jù)不*統(tǒng)計，迄今已從各種微生物發(fā)酵產(chǎn)物中分離得到 20000多種代謝產(chǎn)物純品，其中具有生物活性的代謝產(chǎn)物達(dá) 16000多種。而 MNPD 收集了近幾十年來主要相關(guān)專業(yè)文獻(xiàn)、專著中的微生物代謝產(chǎn)物共 15000多個，其中有確切化學(xué)結(jié)構(gòu)式的共 10000多個。這些多樣性的結(jié)構(gòu)*覆蓋了附表中所列出的所有微生物次級代謝產(chǎn)物的類別。

3、數(shù)據(jù)庫內(nèi)容
MNPD 收集的信息包括以下各個方面的內(nèi)容：
• 基本信息：微生物天然產(chǎn)物的俗名、別名、IUPAC命名、分子式、分子量、化合類型、CAS登記號等
• 物化性質(zhì)和譜圖信息：微生物天然產(chǎn)物的顏色、晶型、熔點(diǎn)、旋光度、溶解性、紫外和紅外特征吸收峰等
• 結(jié)構(gòu)信息：已確定的微生物天然產(chǎn)物的二維分子結(jié)構(gòu)式及利用分子力學(xué)方法優(yōu)化得到的三維分子結(jié)構(gòu)
• 來源和生物活性：微生物產(chǎn)物的產(chǎn)生菌、制備方法及生物活性測試結(jié)果
• 原始參考文獻(xiàn)及zhuan'li信息

4、應(yīng)用前景

MNPD 可以為從事藥物化學(xué)、微生物學(xué)、生物化學(xué)、藥理學(xué)、新藥篩選、天然產(chǎn)物研發(fā)、藥物設(shè)計、組合化學(xué)、化學(xué)信息學(xué)等領(lǐng)域的科研人員提供*的幫助，例如：

• 微生物天然產(chǎn)物的檢索、查新和排重。對每項內(nèi)容均可進(jìn)行精確或模糊查詢，可利用 Query Builder 任意組合字段構(gòu)建聯(lián)合查詢式，提供*的二維和三維分子結(jié)構(gòu)或子結(jié)構(gòu)查詢功能

• 微生物天然產(chǎn)物的主要來源、化學(xué)結(jié)構(gòu)類型、各種生物活性種類的總結(jié)性檢索

• 與藥物設(shè)計軟件和計算化學(xué)軟件結(jié)合，利用微生物天然產(chǎn)物的三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行藥物分子設(shè)計和藥物虛擬篩選研究

• 對微生物天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)及活性信息進(jìn)行定量或定性的分析，研究某類產(chǎn)物的構(gòu)效關(guān)系，為新藥研究提供系統(tǒng)和有價值的信息

• 由于微生物天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)多樣性，可為組合化學(xué)和組合生物學(xué)提供有價值的起始結(jié)構(gòu)和微生物產(chǎn)生菌信息