產(chǎn)品名稱:TonkBio無縫克隆試劑盒價格
英文名稱:Toneker Fast-Fusion Cloning Kit
TonkBio無縫克隆試劑盒價格規(guī)格:
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 產(chǎn)品價格 |
TB10012A | 10 rxns | ¥441 |
TB10012B | 50 rxns | ¥900 |
產(chǎn)品組成:
1、Fast-Fusion Enzyme
2、10× Fast-Fusion Buffer
產(chǎn)品簡介:
Toneclone無縫克隆試劑盒基于DNA序列同源性進行片段重組,可將插入片段PCR產(chǎn)物定向克隆至任意載體的任意位點。將載體在克隆位點進行線性化,并在插入片段PCR引物5’端引入線性化克隆載體末端序列,使得插入片段PCR產(chǎn)物5’和3’zui末端分別帶有和線性化克隆載體兩末端對應(yīng)的**的序列 (15 bp~21 bp)。這種兩端帶有載體末端序列的PCR產(chǎn)物和線性化克隆載體按一定比例混合后,在Fast-Fusion Enzyme的催化下,zui快僅需反應(yīng)5 min,即可進行轉(zhuǎn)化,完成定向克隆??寺£栃月士蛇_95%以上。
Toneclone無縫克隆試劑盒價格,報價產(chǎn)品特點:
1、操作簡便:無需考慮酶切點限制;
2、快速重組:15min實現(xiàn)載體和片段的快速重組;
3、效率更高:重組效率為傳統(tǒng)酶切連接技術(shù)的5-10倍,無載體自連現(xiàn)象,陽性克隆可達90%以上。
Toneclone無縫克隆試劑盒價格,報價產(chǎn)品應(yīng)用:
1、PCR產(chǎn)物克隆進載體
2、基因轉(zhuǎn)移
3、在插入片段前后插入adaptor、linker和標簽
4、高通量克隆
Toneclone無縫克隆試劑盒價格,報價實驗方案
B.制備線性化載體
環(huán)形載體需要經(jīng)過線性化處理,使載體待重組區(qū)域暴露出來,以供與插入片段進行重組拼接。線性化的方法可以通過限制性內(nèi)切酶酶切或PCR方法實現(xiàn)。若采用酶切進行線性化處理,*進行瓊脂糖凝膠電泳檢測,并切膠回收,以盡量避免為切割載體在轉(zhuǎn)化后造成假陽性結(jié)果。若PCR擴增得到線性化載體,*使用高保真聚合酶進行擴增,減少PCR體系中的模板用量以減少初始質(zhì)粒造成的假陽性,并在PCR結(jié)束后對產(chǎn)物進行切膠回收或使用DpnI酶消化殘余質(zhì)粒模板。
C. 插入片段的PCR引物設(shè)計
為了實現(xiàn)同源重組,插入片段擴增產(chǎn)物5’和3’末端需要帶有和線性化克隆載體兩個末端對應(yīng)的**的序列(15−21 bp)。下圖以pUC19作為克隆載體為例,設(shè)計引物:
| Forward Primer → |
|
| 15 bp tract (F) BamHI Gene-specific Primer | |
| 5’-CAG GTC GAC TCT AGA GGATCC XXX XXX …-3’ | |
Vecor pUC19 Clone site | 5’-TGC CTG CAG GTC GAC TCT AGA G | AATTC ACT GGC CGT CGT TTT ACA ACG-3’ |
3’-ACG GAC GTC CAG CTG AGA TCT CCTAG | G TGA CCG GCA GCA AAA TGT TGC-5’ | |
| 3’-… XXX XXX CTTAAG TGA CCG GCA GCA AAA-5’ | |
| Gene-specific Primer EcoRI 15 bp tract (R) | |
| ← Reverse Primer |
D. 插入片段的PCR擴增
插入片段可選用任何DNA聚合酶進行擴增,Taq DNA聚合酶或其他具有校正活力的高保真酶都可以。若用Taq DNA聚合酶,產(chǎn)物末端的A尾在重組過程中將會被去除,不會因此產(chǎn)生單堿基插入突變。*使用高保真酶進行擴增,以減少在插入片段中引入突變。請在PCR完成后,進行瓊脂糖凝膠電泳,確認獲得單一條帶的DNA片段??汕心z回收以除去模板、引物、引物二聚體??赏ㄟ^與已知的DNA分子量marker比較,確定得到的DNA量。
E.重組反應(yīng)體系的建立以及反應(yīng)條件
在冰水浴中,配制如下反應(yīng)體系,將緩沖、水、線性化載體、插入片段加入PCR管中,輕彈混勻,zui后加入酶。
組成成分 | 用量 |
10× Fast-Fusion Buffer | 1 μl |
線性化載體 | 20−100 ng |
插入片段 | 10−100 ng |
ddH2O | 補加至10 μl |
Fast-Fusion Enzyme | 1 μl * |
zui適線性化克隆載體與插入片段摩爾比為1:2,可由下列公式粗略計算獲得:
Ø 線性化載體 = [0.01 × 線性化載體長度 (bp)] ng
Ø 插入片段 = [0.01 × 插入片段長度 (bp)] ng
例如將長度500 bp的插入片段克隆到長度2.7 kb的pUC19中,克隆載體的zui適使用量為:0.01×2700=27 ng,插入片段的zui適使用量為:0.02×500=10 ng。
注意:1. 當插入片段大于克隆載體時,兩者計算用量公式應(yīng)互換。
2. 線性化載體用量應(yīng)在20−100 ng之間,插入片段擴增產(chǎn)物用量應(yīng)在10−100 ng之間。當使用上述公式計算DNA用量超出這個范圍是,請直接選擇zui低/zui高使用量即可。例如插入片段200 bp,zui適用量計算值為4 ng,實際反應(yīng)體系中應(yīng)加入10 ng。
反應(yīng)體系配制完成后,輕彈混勻,并通過短暫離心使其沉到管底,立即放入已預(yù)熱的PCR儀或平衡至所需溫度的水浴中。按下表中方案選其一進行。*在PCR儀中進行反應(yīng),60°C,15 min。(若選擇在37°C水浴反應(yīng),請在10 μl反應(yīng)中加入2 μl Fast-Fusion Enzyme。)反應(yīng)結(jié)束后應(yīng)立即將反應(yīng)管置于冰水浴中冷卻10 min,然后直接轉(zhuǎn)化。也可選擇−20°C儲存,待需要時,冰上解凍并轉(zhuǎn)化。
PCR熱循環(huán)儀 | 水浴 | |
70°C, 5 min | 60°C, 15 min | 37°C, 15 min |
4°C, ∞ | 4°C, ∞ | 冰水浴 |
F.轉(zhuǎn)化
*使用轉(zhuǎn)化效率≥108 cfu/μg的感受態(tài)細胞,按照對應(yīng)的說明書操作。若轉(zhuǎn)化效率低于108 cfu/μg,可在凃布前將培養(yǎng)的菌液在6000 rpm離心5 min,沉菌用100 μl培養(yǎng)基重懸后,全部涂于對應(yīng)抗性的平板上。過夜培養(yǎng)后,形成數(shù)百個單克隆,可根據(jù)需要選擇PCR或酶切鑒定是否為陽性。
G.常見問題與解決方案
問題 | 可能的原因 | 解決方案 |
平板上無克隆或克隆數(shù)目很少 | 引物序列不正確 | l 確認引物序列含有15 bp與載體插入?yún)^(qū)域**的同源序列。 |
PCR產(chǎn)物不純 | l 優(yōu)化PCR擴增反應(yīng)以得到單一PCR產(chǎn)物。 l 換一種純化方法,純化您的PCR產(chǎn)物。 | |
反應(yīng)體系中DNA濃度太低 | l 在重組反應(yīng)中,加入*的DNA量。 | |
不純的載體或插入片段抑制重組反應(yīng) | l *采用膠回收或離心柱法純化DNA后進行重組反應(yīng)。 | |
轉(zhuǎn)化過程中加入重組反應(yīng)液過多 | l 重組反應(yīng)液的轉(zhuǎn)化體積不應(yīng)超過轉(zhuǎn)化細胞體積的1/10。 | |
感受態(tài)細胞轉(zhuǎn)化效率低 | l 更換新鮮、高效的感受態(tài)細胞。 | |
培養(yǎng)基中加入錯誤或過多抗生素 | l 在轉(zhuǎn)化平板中加入正確、適量的抗生素。 | |
假陽性克隆數(shù)目多 | 克隆載體線性化不* | l 重新酶切您的載體,增加酶切時間,并膠回收純化。 |
PCR使用的模板質(zhì)??剐耘c所需克隆載體抗性相同造成的污染 | l 可在PCR反應(yīng)之前先將模板質(zhì)粒線性化。 l PCR產(chǎn)物用DpnI處理,消化模板質(zhì)粒,然后再純化。 | |
轉(zhuǎn)化用平板放置時間過長導(dǎo)致抗性失效 | l 確認平板新鮮配置,并含有正確、適量的抗生素。 | |
克隆含有不正確的插入片段 | PCR產(chǎn)物混有非特異性片段 | l 優(yōu)化PCR擴增體系,提高特異性或膠回收純化目的片段。 |