DCode 通用突變檢測(cè)系統(tǒng)可采用以下任一電泳技術(shù)檢測(cè)單堿基變化:
單鏈構(gòu)象多態(tài)性 (SSCP)
變性梯度凝膠電泳 (DGGE)
均一變性凝膠電泳 (CDGE)
時(shí)間溫度梯度電泳 (TTGE)
DCode 系統(tǒng)靈活且功能強(qiáng)大,是可以執(zhí)行任何技術(shù)組合的電泳系統(tǒng)。 系統(tǒng)*是溫度控制模塊(該模塊包括一個(gè)由微處理器控制的加熱器、一個(gè)緩沖液再循環(huán)泵和一個(gè)攪拌器)。 對(duì)于需要精確溫度控制的技術(shù)(例如 SSCP 和 TTGE),請(qǐng)將凝膠浸入緩沖液中,并將溫度調(diào)節(jié)在 5° 和 70°C 之間。將冷卻槽與外部實(shí)驗(yàn)室冷卻器結(jié)合使用可以實(shí)現(xiàn)低于環(huán)境溫度的任何運(yùn)行溫度。 DCode 系統(tǒng)運(yùn)行 64 份樣品只需 2 小時(shí) — 篩選 DNA 以了解序列變化時(shí),可重點(diǎn)考慮該系統(tǒng)。
您可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求對(duì)DCode 系統(tǒng)進(jìn)行相應(yīng)配置。 每個(gè)系統(tǒng)包括一個(gè)垂直電泳槽和各種針對(duì) SSCP、DGGE、CDGE 和 TTGE(一種由 Bio-Rad 共同研發(fā)的技術(shù))所適用的試劑盒。 作為一種由 Bio-Rad 共同研發(fā)的技術(shù),TTGE 具有 DGGE 和 CDGE 的所有優(yōu)點(diǎn)且不需要化學(xué)變性劑梯度。
這種系統(tǒng)的靈活性使您能夠快速添加新的研究工具而不需要投資購買新儀器。 通過使用“Accessories”(配件)選項(xiàng)卡上列出的特定技術(shù)的適配試劑盒補(bǔ)充核心系統(tǒng),可將檢測(cè)系統(tǒng)擴(kuò)展為執(zhí)行任意檢測(cè)方法的系統(tǒng)組合。 產(chǎn)品選項(xiàng)包括完整的 DCode 系統(tǒng)及針對(duì)不同電泳技術(shù)(DDGE、CDGE、TTGE 和 SSCP)的 DCode 系統(tǒng)。
WinMelt™ 軟件
當(dāng)序列差異出現(xiàn)在相關(guān) DNA 的zui低解鏈溫度區(qū)域時(shí),突變zui容易檢出。 此外,僅當(dāng)分子未*變性時(shí),才能獲得*電泳分辨率。 通過 PCR 將 GC 鉗添加到 DNA 的一端可確保篩選的區(qū)域處于較低的解鏈溫度范圍內(nèi),并且 DNA 將部分保留雙鏈。 這樣同時(shí)增強(qiáng)了檢測(cè)電泳能力和分辨率。 基于 Windows 的 WinMelt 軟件可以預(yù)測(cè)zui多達(dá) 3,200 個(gè)堿基的任何 DNA 序列的解鏈圖譜。 可以通過分析引物和 GC 鉗對(duì) DNA 解鏈圖譜的影響來優(yōu)化它們的位置。
WinMelt 軟件的操作很簡(jiǎn)單。 DNA 序列支持文本文件導(dǎo)入,解鏈圖譜可計(jì)算生成。 該數(shù)據(jù)顯示在屏幕上,并且可根據(jù)用戶需要將其繪制成圖表。同時(shí)可導(dǎo)出序列和熔解數(shù)據(jù)以便用于其他程序。 WinMelt 軟件*用于所有 DGGE、CDGE 和 TTGE 應(yīng)用。
電泳試劑和對(duì)照試劑
Bio-Rad 電泳檢測(cè)試劑盒針對(duì)每種應(yīng)用而定制,可確保提供品質(zhì)*的緩沖液和丙烯酰胺凝膠。 我們的 DGGE、CDGE、TTGE 和 SSCP 對(duì)照試劑可幫助您快速掌握任何新技術(shù)。
應(yīng)用
提供包含已驗(yàn)證的 DCode 系統(tǒng)運(yùn)行條件的技術(shù)注解。 要獲得所有 DCode 系統(tǒng)應(yīng)用說明,請(qǐng)索取文獻(xiàn)包 1720J。 要在微生物多樣性研究方面獲得 DCode 系統(tǒng)應(yīng)用說明,請(qǐng)索取文獻(xiàn)包 1720K。
培訓(xùn)指南
培訓(xùn)指南是一種交互式 CD-ROM,可幫助您了解使用 DCode 系統(tǒng)篩選突變的技術(shù)。 它包括以下內(nèi)容:
DGGE、CDGE、TTGE 和 SSCP 的原理
有關(guān)設(shè)置和使用 DCode 系統(tǒng)的視頻
WinMelt 軟件教程程序、DCode 應(yīng)用說明、適用手冊(cè)和其他文獻(xiàn)
要獲得培訓(xùn)指南,請(qǐng)索取貨號(hào) 170-9241。 該 CD-ROM 只與 PC 兼容。
D GENE™ 用戶注意
除 SSCP 適配試劑盒以外,所有 DCode 適配試劑盒都與 D GENE 儀器兼容。 要在室溫以下運(yùn)行凝膠,請(qǐng)將 D GENE 系統(tǒng)放在冷庫或配備電源插座的致冷器中,并使用溫度控制器設(shè)置所需的運(yùn)行溫度(bullitin 1935)。 基本 SSCP 適配試劑盒與 D GENE 系統(tǒng)相容,但需要使用一個(gè)低于室溫的電泳冷庫。
技術(shù)參數(shù)
DCode 通用突變檢測(cè)系統(tǒng)
組分
電泳槽、核心部件和管夾:電泳槽: 模壓聚碳酸酯;模芯: 模壓聚砜;管夾: 填充了玻璃的膜壓聚碳酸酯
梯度儀:灌制丙烯酸和鋁
蓋子:聚碳酸酯
電極:直徑為 0.010" 的鉑金絲
電導(dǎo)線:靈活,直接
玻璃板:20 x 20 cm(20 cm 格式內(nèi)板)
凝膠尺寸:16 x 20 cm(每次zui多兩個(gè))
可用的間隔條:0.75、1.0、1.5 mm
梳:16、20、25 和 32 (* 1 mm)孔梳和 1 孔梳(制備梳適用于垂直梯度膠)
灌膠架:根據(jù)設(shè)置灌制兩個(gè) 16 x 16 cm、兩個(gè) 16 x 10 cm、兩個(gè) 16 x 20 cm 或四個(gè) 7.5 x 10 cm 凝膠
加熱器和控制:凝膠區(qū)域中的溫度控制(PID 類型)±0.5°C 變化,45–70°C 范圍內(nèi)實(shí)際上下波動(dòng) 0.5°C
zui高設(shè)置溫度:70.5°C
直流電壓/功率限制:500 V 直流電壓限值;50 W 功率限值
尺寸和重量
尺寸(寬 x 深 x 高):蓋子和槽附件: 39 x 20 x 42 厘米
重量:16 kg (35.3 lb)
電源要求
交流電源要求:交流電輸入功率: 120 VAC 47–63 Hz,5 A 慢斷保險(xiǎn)絲
(貨號(hào) /9086/9089/9092/9095/9098/9102)
直流電源要求:外部直流電壓電源;電源必須以直流電壓輸出相對(duì)于地懸浮的方式與地隔離
zui大電壓限制: 500 V 直流電
zui大功率限制: 50 W
環(huán)境要求
儲(chǔ)存環(huán)境:0–70°C,濕度 0–95%(無冷凝)
操作環(huán)境:0–35°C,濕度 0–95%
安全規(guī)范:符合 IEC 1010-1 和 FCC(A 級(jí)別)的要求
475 型梯度傳送系統(tǒng)
尺寸和重量:22 x 21 cm(寬 x 高);2.28 kg (5 lb)
載量:總共 50 ml(25 ml/注射器)
WinMelt™ 軟件
系統(tǒng)要求:486 MHz或更高配置的 CPU,CD-ROM 驅(qū)動(dòng)器