時至今日，代謝組學已經(jīng)成為生物組學研究領域的重要組成部分。通過檢測生物樣本中小分子代謝物，使得我們對于各種生物體的代謝系統(tǒng)以及代謝組與基因組、轉錄組和蛋白質組在生命的分子過程中的相互作用有了深入的理解。
高分辨質譜(HRMS)技術結合生物信息學和統(tǒng)計分析是當前表征生物樣本中小分子代謝物的主要手段之一。然而，由于生物體內代謝物的結構復雜、多樣，實現(xiàn)生物樣本中小分子代謝物的全覆蓋鑒定和準確定量分析仍然是本領域的主要挑戰(zhàn)。其中，大極性、離子代謝物的檢測尤其受到關注。離子色譜主要使用離子交換的分離原理，和常規(guī)液相色譜主要基于疏水吸附的反相分離原理形成互補，可以很好分離常規(guī)液相色譜難以分離的強極性可電離代謝物。即使是基于親水相互作用的HILIC色譜可以分離強極性代謝物，但也難以分離強電離代謝物。離子型物質分離，必須使用離子型物質做為流動相，但離子型物質本身與質譜的最佳檢測環(huán)境并不兼容。因此，我們需要安裝膜抑制器作為一個持續(xù)工作的脫鹽裝置，通過膜轉移的原理去除對位離子，使酸堿變成純水，從而實現(xiàn)與質譜兼容。
圖1 不同極性化合物需要不同的色譜分離系統(tǒng)進行分析
分離度
核苷酸、糖類等在代謝通路中存在多個同分異構體，這些同分異構體在細胞代謝中承擔著不同且重要的功能。因此，我們不僅需要檢出相關化合物，更需要將這些同分異構體代謝物進行有效色譜分離。圖2展示了IC與HILIC分析21種極性代謝物對照品的分離效果。大部分化合物在HILIC色譜柱上出峰情況良好，然而，對于磷酸糖類以及順式、反式丁烯二酸等同分異構體代謝物來說，HILIC的分離效果明顯差于IC。在細胞樣本的測試中，不同色譜條件下對m/z 259.0224進行提取離子流(圖3)。IC色譜條件下檢測到了11個色譜峰，檢出數(shù)量和強度顯著高于其他色譜條件。根據(jù)精確質荷比信息，推測該系列化合物的元素組成為C6H13O9P，在代謝物數(shù)據(jù)庫中檢索，有至少33個代謝物符合該元素組成，其中包括葡萄糖、果糖、半乳糖、甘露糖等多種重要的磷酸單糖。
圖2 21種代謝物對照品使用IC和HILIC進行分離的峰形比較
圖 3 細胞樣本中磷酸單糖化合物在不同色譜條件下的色譜分離比較
靈敏度
在濃度為60 ppb(0.2-0.7 μmol/L)的情況下，使用IC-MS分析極性代謝物對照品。(圖2)這些代謝物的信噪比(S/N)約為1000，相當于柱上量0.5-2.5 pmol。其中一半的代謝物可在非常低的濃度下(60 ppt，相當于柱上樣量3.4 fmol以下)被檢測到，信噪比在3到20之間。最低檢測限(LODs)的濃度范圍為0.04-0.5 nmol/L(見表1)，展示了超高靈敏度。
表1 21種代謝物在cap IC-Orbitrap平臺的最低檢測限(LODs)
重現(xiàn)性
在連續(xù)6天的日間穩(wěn)定性考察中，每天平行測試6針對照品混標(600 ppb)，所有化合物的保留時間和響應強度RSD均小于8%，完全適應代謝組學分析要求。(圖4)在實際細胞樣本測試中，6種細胞中的11種磷酸單糖以及穩(wěn)定同位素內標馬尿酸-d5的色譜保留時間和響應強度同樣表現(xiàn)出良好的重現(xiàn)性(n=3)。
圖4 日間重現(xiàn)性考察(n=6)
圖5 不同細胞樣本中11種磷酸單糖的離子流圖
代謝通路覆蓋度
采用IC-MS的方法進行細胞代謝組學分析，幾乎完整地覆蓋了糖酵解途徑和三羧酸循環(huán)(TCA)的主要代謝物。(圖6)通過相關測試結果，可以幫助我們有效觀察細胞能量代謝、代謝穩(wěn)態(tài)的變化。
圖6 糖酵解、TCA代謝途徑及細胞樣本中相關代謝物含量測試結果
小結
離子抑制技術的發(fā)展，特別是連續(xù)電解離子抑制技術，使得離子交換色譜與高分辨質譜的結合成為可能，這種組合帶來了新的分析機會。IC-MS平臺技術的商業(yè)化推廣使得越來越多的實驗室探索了IC-MS的新應用領域，并揭示了超出傳統(tǒng)應用領域的成功案例。例如，除了對無機離子的分析外，有機和生物極性和離子分析物已經(jīng)成功地在廣泛的環(huán)境和生物樣品類型中進行了有針對性的分析和表征。使用離子抑制的IC-MS分析具有產(chǎn)生洗脫劑和極性選擇性的組合特性，減少了有效基質復雜性，降低了質譜檢測中可能導致分析干擾的基質效應和色譜擁擠。分析物通常已經(jīng)處于離子形式；因此，通過質譜檢測實現(xiàn)高靈敏度分析可以最大程度地減少離子抑制。相比之下，用于離子和高極性分析物表征的其他色譜方法(如RP-MS、HILIC-MS、GC-MS和IP-MS)可能抑制分析物的離子特性(使用低質子溶劑、衍生化等)，以便提供有效的分析條件，這可能導致覆蓋范圍和信號抑制的偏差。總之，IC-MS已經(jīng)成為一種有效的互補(或替代)分析工具，表現(xiàn)出高水平的平臺穩(wěn)定性、保留時間重現(xiàn)性、靈敏度和低檢測限。迄今為止，大多數(shù)應用集中在法醫(yī)科學、環(huán)境科學、技術和制造業(yè)以及食品化學領域。然而，在制藥科學、臨床化學、診斷學、微生物學、代謝組學和細胞生物學等領域的應用越來越多，這些領域還有許多重要的進一步發(fā)展和應用的空間(圖5)。無論是在復雜基質中還是在高極性或離子分析物中，IC-MS都有新的應用空間。展望未來，我們認為IC-MS的未來應用將包括對復雜生物和環(huán)境系統(tǒng)和過程的深入研究，宿主-病原體關系，微生物組代謝，植物與土壤化學之間的關系，藥代動力學和藥效動力學，以及與疾病的診斷、預后和病因相關的生物標志物研究。從傳統(tǒng)意義上講，這些領域在分析上具有特殊的挑戰(zhàn)性，特別是在使用非靶向方法時；因此，IC-MS在發(fā)現(xiàn)導向和有針對性應用中有潛力發(fā)揮重要作用。
參考文獻：
[1] Wang J, Christison TT, Misuno K, et al. Metabolomic profiling of anionic metabolites in head and neck cancer cells by capillary ion chromatography with Orbitrap mass spectrometry. Anal Chem. 2014;86(10):5116-5124. doi:10.1021/ac500951v
[2] Hu S, Wang J, Ji EH, Christison T, Lopez L, Huang Y. Targeted Metabolomic Analysis of Head and Neck Cancer Cells Using High Performance Ion Chromatography Coupled with a Q Exactive HF Mass Spectrometer. Anal Chem. 2015;87(12):6371-6379. doi:10.1021/acs.analchem.5b01350
[3] Ngere JB, Ebrahimi KH, Williams R, Pires E, Walsby-Tickle J, McCullagh JSO. Ion-Exchange Chromatography Coupled to Mass Spectrometry in Life Science, Environmental, and Medical Research. Anal Chem. 2023;95(1):152-166. doi:10.1021/acs.analchem.2c04298
[4] McCullagh J, Probert F. New analytical methods focusing on polar metabolite analysis in mass spectrometry and NMR-based metabolomics. Curr Opin Chem Biol. 2024;80:102466. doi:10.1016/j.cbpa.2024.102466
[5] Skaripa-Koukelli I, Hauton D, Walsby-Tickle J, et al. 3-Bromopyruvate-mediated MCT1-dependent metabolic perturbation sensitizes triple negative breast cancer cells to ionizing radiation. Cancer Metab. 2021;9(1):37. Published 2021 Oct 14. doi:10.1186/s40170-021-00273-6
[6] Haythorne E, Lloyd M, Walsby-Tickle J, et al. Altered glycolysis triggers impaired mitochondrial metabolism and mTORC1 activation in diabetic β-cells. Nat Commun. 2022;13(1):6754. Published 2022 Nov 14. doi:10.1038/s41467-022-34095-x
[7] Sun Y, Saito K, Iiji R, Saito Y. Application of Ion Chromatography Coupled with Mass Spectrometry for Human Serum and Urine Metabolomics. SLAS Discov. 2019;24(7):778-786. doi:10.1177/2472555219850082
[8] Hirayama A, Tabata S, Kudo R, et al. The use of a double coaxial electrospray ionization sprayer improves the peak resolutions of anionic metabolites in capillary ion chromatography-mass spectrometry. J Chromatogr A. 2020;1619:460914. doi:10.1016/j.chroma.2020.460914
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