真空系統(tǒng)的作用是排出從冷阱中抽出的不可凝性氣體和空氣,以建立能保持制品升華速率的真空度。高真空度有效地降低了水蒸氣氣流的阻力,同時在干燥過程中由于沒有空氣的存在,也就避免了氧化作真空冷凍干燥時，冷阱內的壓強，不是越低越好，而是要控制在一定的范圍之內。壓強低當然有利于產(chǎn)品內冰的升華。但由于壓強太低時對傳熱不利，產(chǎn)品不易獲得熱量，升華速率反而降低。

　　當壓強太高時，產(chǎn)品內冰的升華速率減慢，于是產(chǎn)品自身的溫度上升，當高于一定程度時，產(chǎn)品將發(fā)生熔化，造成凍干失敗。

　　使用真空冷凍干燥機時,必須對儀器各部件進行*的清潔，不銹鋼的部件使用乙醇進行清洗，有機玻璃使用鹽水進行清洗。安瓿瓶用超聲波清洗機進行清洗。

　　冷凍干燥之前必須要進行預凍，欲動需要準備低溫冰箱，零下40攝氏度，或者是零下80攝氏度的低溫冰箱，把準備干燥的物品置于低溫冰箱或液氮中，一般需要四個小時左右，可以直接從外面進行觀察到，物品*冰凍結實后，才可進行冷凍干燥的實驗，把物品迅速移動到真空冷凍干燥機托盤之內，以保證冷凍干燥效果。

　　真空泵運轉前必須檢查是否加入真空泵油，否則不能正常運行。油面不得低于油鏡的中線，真空泵剛開始時使用時有比較強烈的抖動，慢慢的會變的平穩(wěn)。