未知代謝物鑒定檢測技術(shù)服務(wù)-詳情介紹:
代謝組學(xué)一般根據(jù)以下四個維度對代謝物鑒定的可信度進(jìn)行劃分:可靠的鑒定得到的化合物(1級),通過假定注釋得到的化合物(2級),通過假定注釋對化合物類別進(jìn)行鑒定(3級)和未知化合物(4級)。1級鑒定需要將目標(biāo)代謝物的兩個或多個正交特性(如保留時間、m/z和碎片質(zhì)譜)與在相同分析條件下觀察到的真實(shí)化學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品的相同特性進(jìn)行比較。推定(第2級或第3級)注釋基本上僅依賴于一個或兩個特性,且通?;趯Σ煌瑢?shí)驗(yàn)室收集的以及不同分析方法獲得的數(shù)據(jù)的比較,而不是在相同分析條件下與真正的化學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品的直接比較。
未知代謝物指可以反復(fù)檢測到的但其化學(xué)身份尚未確定的小分子。這些化合物雖然尚未被鑒定和分類,但在代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)中仍可根據(jù)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行區(qū)分和定量。在LC-MS實(shí)驗(yàn)中,一個未知化合物將由唯|yi的保留時間、一個或多個質(zhì)量或一個特定的初級離子碎片模式定義。在NMR實(shí)驗(yàn)中,一個未知化合物將由化學(xué)位移的模式定義。未知物可能代表先前沒有被識別的小分子,例如代謝的次級產(chǎn)物或罕見的外源性物質(zhì),或者它們可能由已建立的途徑構(gòu)成分子但無法分配到現(xiàn)有的NMR參考譜庫或MS碎裂模式。
未知化合物的鑒定非常耗時且成本高昂,通常需要進(jìn)行制備規(guī)模的分離以進(jìn)行NMR研究,或大量的化學(xué)合成才能使用MS/MS進(jìn)行結(jié)構(gòu)比較。因此,大多數(shù)報告都集中于檢測具有可用的真實(shí)商業(yè)標(biāo)準(zhǔn)品或至少存在于代謝物數(shù)據(jù)庫中的代謝物,即分類為1級,2級和3級的代謝物。由于許多代謝物固有的不穩(wěn)定性和需求的缺乏,僅有數(shù)千種商業(yè)分析標(biāo)準(zhǔn)品可用。然而,這些標(biāo)準(zhǔn)品和數(shù)據(jù)庫中存在的代謝物僅占內(nèi)源性代謝物很小的一部分。因此,對于代謝組學(xué)研究來說,有效的方法來排序、研究和zuì |終鑒定非特征代謝物是非常重要的。未知代謝物的成功鑒定將對生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和組學(xué)研究產(chǎn)生重大影響。
未知代謝物鑒定
為了鑒定代謝組學(xué)樣品中的未知化合物,應(yīng)區(qū)分不同類別的代謝物,具有相同可分辨公稱質(zhì)量(nominal mass)的,具有相同可分辨公稱質(zhì)量但分子式和同位素質(zhì)量不同的,相同可分辨公稱質(zhì)量和同位素質(zhì)量但化學(xué)結(jié)構(gòu)不同的,都應(yīng)該對其進(jìn)行區(qū)分。例如,亮氨suān |和異亮氨suān |是結(jié)構(gòu)不同的異構(gòu)tǐ |,但是可分辨公稱質(zhì)量和同位素質(zhì)量相同。此外,由于單一代謝物可以在質(zhì)譜儀中檢測到不同的衍生物種,所以正確地將不同的衍生物種分配給母tǐ |代謝物也是很重要的。例如,在氨基suān |分析中,三甲基硅wán |化(TMS)與氨基suān |發(fā)生化學(xué)衍生反應(yīng)會生成含有1、2或3個TMS基團(tuán)的氨基suān |,這些氨基suān |都應(yīng)屬于同一母tǐ |氨基suān |。
百泰派克生物科技結(jié)合NMR,LC-MS/MS和生物信息學(xué)分析法,提供基于質(zhì)譜的識別未知代謝物的分析服務(wù),可以準(zhǔn)確鑒定復(fù)雜生物樣品中的代謝物。百泰派克生物科技不斷開發(fā)工具和數(shù)據(jù)庫,期望能夠?qū)崿F(xiàn)以自動化的方式對所有代謝物進(jìn)行真實(shí)和完整的鑒定。歡迎咨詢!
未知代謝物鑒定檢測技術(shù)服務(wù)-詳情介紹
百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測服務(wù)。
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